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苹果短信清空后仍然显示一个1，这通常意味着短信应用中的某个地方仍然有未读或未处理的消息。这可能是由以下几个原因导致的。
1、未完全删除短信：可能只是删除了部分短信，而仍有未读短信留在短信应用中，可以进入短信应用，检查是否有未读或未处理的消息。
2、通知标记未更新：即使短信已经被删除，通知标记可能没有及时更新，可以尝试重启设备，这通常可以刷新系统并更新相关标记。
3、短信应用出现错误：可能是短信应用本身出现了错误，可以尝试关闭短信应用，然后重新打开，或者通过强制关闭并重新打开应用来解决问题。
4、系统缓存问题：可能是系统缓存导致的错误显示，可以尝试清理应用缓存，或者通过恢复设备的出厂设置来解决这个问题。
如果以上方法都无法解决问题，建议联系苹果官方客服进行咨询，他们可能会提供更专业的解决方案。